「这是怎样……？动手的不是我们。有人从装甲板内部进行破坏耶……？」
「……那是…芙罗兰·克洛伊杜尼……？」
以神秘方式让上条及雷神索尔昏倒的芙罗兰·克洛伊杜尼，消失在夜晚的学园都市中。
另一方面，迷路的芙蕾梅亚·塞维伦与最后之作很不可思议地会合了。
「臭小鬼！」
「这个小孩是怎样啦！御坂表——」
芙罗兰·克洛伊杜尼造成的骚动瞬间传开，「捣蛋鬼」和欧雷尔斯势力即将有所动作。
而上条他们能做的事——
「将这个情报伪装成陷阱。只要双方擅自相互提防，就算知道芙罗兰·克洛伊杜尼的所在地也很难出手，只要趁这段时间，从中突破把她带走就好。」
两人使用雷神索尔的变身魔法和学校电脑做出欺敌的通缉令，并刻意让玛莉安·史琳格奈亚看见，成功地让她起了不必要的戒心。
「接下来是欧雷尔斯那边了。」
「一旦『捣蛋鬼』有什么轻举妄动，他们也会注意到。只要把情报交给为了详细侦查而接近的间谍……」
为了扰敌而开始行动的上条，找到了欧雷尔斯势力的斥侯。然而，对方是他认识的人。
「蕾薇妮雅·柏德蔚……！」
「马上把这个玩具给我拿开。我们之间已经没有那种跪地求饶还有用的交情了。」
这时，上条遭到介入争端的警卫枪击。蕾薇妮雅·柏德蔚则在为上条急救时，拿走了他的学生手册。
「上条当麻跟玛莉安·史琳格奈亚似乎有联系。『捣蛋鬼』在第十二学区，要击溃他们就趁现在。」
「……上钩了。」
难以将芙罗兰·克洛伊杜尼带回的学园都市暗部，决定把受到严格控管的那名等级5超能力者投入实战。
「垣根帝督先生，我们『木原』欢迎你这项科学，你就随自己高兴去行动吧。最好做到足以破坏『木原』这边所写下的剧本。」
「……」
当事者芙罗兰·克洛伊杜尼则遇到了最后之作和芙蕾梅亚·塞维伦这两名少女。她们这么说：
「喵！这样我们就是朋友了！」
「反正也交换联络方式了，随时都可以联络我们喔，御坂御坂得意地说道。」
使用特殊方法潜入学园都市的魔法师灰姑娘，虽然因为麦野弄错分量使身体尺寸缩小，却仍旧为了向「捣蛋鬼」复仇而独自展开行动。
「虽然很难找到『捣蛋鬼』的正规部队，不过只要待在上条当麻身边……」
深夜的街头，麦野沉利看到一名诡异的人物，那是过去自己曾亲手杀死的少女。
「芙兰……达……！」
「到头来，你究竟理解了什么都跟我无关啦！」
由统括理事长直接制作的程式，问答型思考辅助式人工智慧如此说道：
「坦白说，为了一口气取得『羽化』所需的大
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